De waarde van de certificaten wordt jaarlijks in overleg met de accountant vastgesteld bij het vaststellen van de jaarrekening en tijdig (voor 1 mei) gedeeld met de deelgenoten. Deze waarde is bedoeld om als particulier je box 3 aangifte inkomstenbelasting bij de Belastingdienst te kunnen doen. De waarde van het certificaat wordt bepaald door het resultaat van Burgerboerderij De Patrijs BV. Omdat De Patrijs momenteel geen winst maakt is de waarde van het certificaat nu lager dan de nominale waarde.